Por que ele não cobra exatamente o meu saldo?

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Não existe forma de nenhum app cobrar uma quantia arbitrária pela App Store. A Apple só oferece um conjunto fixo de preços para compras dentro do app, então o desenvolvedor não consegue criar uma cobrança única para, digamos, os 46 exatos que sobraram na sua conta. O Zero Balance contorna isso da única maneira possível: trata esses preços fixos como moedas e monta uma combinação que soma o mais perto possível do que sobrou. Quanto mais preços houver para trabalhar, menor o excesso - e é por isso que o app se espalha por várias faixas pequenas em vez de depender de uma ou duas.